Resistoma as an Indicator of Change in Patagonian Basins

Resistoma as an Indicator of Change in Patagonian Basins

Le résistome en tant qu'indicateur de changement dans les bassins versants patagoniens

2024 OHM Project Patagonia - Bahia Exploradores OHMi

Leader : De la Iglesia Rodrigo

Project leader’s laboratory : Laboratorio de Microbiología Marina, FCB, PUC.
Full address of laboratory : Libertador General Bernardo O'Higgins 340, Santiago, Chile

Coauthor(s) : Alfaro Fernando

Keywords :

Resistome antimicrobial bacterial resistance

Disciplines :

Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Biologie environnementale, écologie et évolution

Abstract :

The current climate emergency highlights the significant impact of human activities on the planet's biogeochemistry. Almost all ecosystems have been affected by human-made substances and nutrient imbalances caused by various productive activities. It is essential to develop strategies that help us understand, identify, and reduce the harmful effects of these imbalances on the environment, with an emphasis on biodiversity. One of the main concerns is antimicrobials, which are widely used to control microbial activity and growth. The chronic accumulation of these compounds in habitats has caused significant changes in the genetic composition of organismos from multiple trophic levels. Microorganisms can to transfer resistance genes between different species, making it crucial to detect, identify, and quantify this resistome to determine the intervention state of an ecosystem. This project aims to address the urgent climate emergency and its impact on planetary biogeochemistry in the Patagonian fjords, a biodiverse ecosystem threatened by increasing human activities. Due to human-made compounds and nutrient imbalances, the pristine landscapes of the fjords are at risk, demanding comprehensive strategies to understand, detect, and mitigate these threats to the region's rich biodiversity. UBy using field sampling, molecular tools, and bioinformatic analysis, we aim to obtain a detailed map of the resistome composition of the Exploradores Valley, one of the many fjord areas under this threat.

Translated abstract :

L’urgence climatique actuelle met en évidence l’impact important des activités humaines sur la biogéochimie de la planète. Presque tous les écosystèmes ont été affectés par les substances d’origine humaine et les déséquilibres nutritionnels provoqués par diverses activités productives. Il est essentiel de développer des stratégies qui nous aident à comprendre, identifier et réduire les effets néfastes de ces déséquilibres sur l’environnement, en mettant l’accent sur la biodiversité. L’une des principales préoccupations concerne les antimicrobiens, qui sont largement utilisés pour contrôler l’activité et la croissance microbiennes. L'accumulation chronique de ces composés dans les habitats a provoqué des changements importants dans la composition génétique des organismes à partir de plusieurs niveaux trophiques. Les micro-organismes peuvent transférer des gènes de résistance entre différentes espèces, ce qui rend crucial la détection, l'identification et la quantification de ce résistome pour déterminer l'état d'intervention d'un écosystème. Ce projet vise à répondre à l’urgence climatique urgente et à son impact sur la biogéochimie planétaire dans les fjords de Patagonie, un écosystème à la biodiversité menacé par l’augmentation des activités humaines. En raison des composés d'origine humaine et des déséquilibres en nutriments, les paysages vierges des fjords sont en danger, ce qui nécessite des stratégies globales pour comprendre, détecter et atténuer ces menaces qui pèsent sur la riche biodiversité de la région. En utilisant l'échantillonnage sur le terrain, des outils moléculaires et des analyses bioinformatiques, nous visons à obtenir une carte détaillée de la composition des résistomes de la vallée des Exploradores, l'une des nombreuses zones de fjords menacées.