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Proxy 2 - Rétro-observation des espèces par le Proxy ADN ancien: apport de l'étude de la biodiversité du passé à la compréhension des processus évolutifs et écologiques dans les lacs d'altitude
Morgane Gibert
Session
2020
Co-porteur(s)
Didier GALOP
Type de projet
Projet OHM
OHM(s) concerné(s)
  • OHM Pyrénées Haut Vicdessos
Anthropologie, Écologie, Génétique, Géographie
Le projet de recherche proposé ici s'inscrit dans la continuité des projets DYVAH et FISH portés par D. Galop. Il s'intéresse à la reconstitution des dynamiques environnementales et à l'anthropisation des lacs d'altitude. Le but est de développer une méthodologie originale reposant sur l'analyse de l'ADN ancien au sein des archives sédimentaires afin de contribuer à la caractérisation de la biodiversité ancienne des lacs et des interactions Homme-Milieux.
L'objectif est d'analyser l'impact de l'Homme sur ses environnements qu'il s'agisse par exemple du pastoralisme ou d'évènements plus récents tels que l'empoissonnement des lacs. Le projet propose d'apporter par une approche métabarcoding une vision globale de la biodiversité passée complémentaire de celles apportées par d'autres proxies tels que l'étude des pollens, macro-fossiles etc.. Parallèlement, le suivi d'espèces cibles sera réalisé par séquençage après capture par hybridation de sondes spécifiques.

Porteur

Morgane Gibert
2019-12-10 15:43:08
2019-12-09 08:25:51
Morgane Gibert
Mes activités de recherche s'intéressent à la diversité et à la dynamique biologique des populations humaines actuelles et à son interprétation en termes d'histoire du peuplement et des interactions « Hommes-Milieux ». La période considérée est essentiellement celle de l'Holocène à aujourd'hui avec deux approches possibles à savoir moléculaire et biodémographique conjuguant des échelles spatio-temporelles complémentaires. Cette dernière approche permet d'appréhender les interactions Hommes-Milieux à l'échelle des derniers siècles et d'une manière plus systémique.

Participants

Didier
GALOP
Les recherches de D. Galop sont centrées sur l'étude des relations et des co-évolutions environnement-sociétés sur la longue durée. Elles s'appuient sur une rétro-observation interdisciplinaire des processus socio-écologiques qui combine l'étude multi-proxy du contenu paléobiologique d'archives sédimentaires (Pollen, microfossiles non-polliniques, stomates, microcharbons) à des approches éco-historiques
(archives textuelles, cartes anciennes, etc...) et biogéographiques. Principalement orientées vers
l'étude des dynamiques propres aux milieux montagnards (Pyrénées, Massif central, Tyrol), ses recherches en cours concernent l'étude des relations climat-sociétés en haute montagne
pyrénéenne (projets ANPYR et ROECEPAL) et l'étude des relations entre pratiques pastorales et
diversité végétale au cours des 8000 dernières années.
Simon
Blanchet
Les recherches de S. Blanchet s'intéressent aux dynamiques écologiques et évolutive dans les
écosystèmes aquatiques : le but est de comprendre les profils de biodiversité notamment de ces milieux
et leurs conséquences sur le fonctionnement des écosystèmes. Un regard particulier est accordé à la
diversité intra-spécifique mais les intérêts sont diverses et inclus les interactions hôtes-parasites,
l'écologie fonctionnelle, l'écologie évolutive, la dynamique et le fonctionnement des écosystèmes,
les règles d'assemblage des communautés, les impacts des changements globaux, le transfert
d'informations utiles en écologie, la plasticité phénotypique et la génétique des populations. Les
approches employées sont des approches moléculaires, empiriques et/ou expérimentales.
Ludovic
Orlando
Ludovic Orlando (LO) est DR2 CNRS et a exercé
pendant les 8 dernières années comme Professeur
d’Archéologie Moléculaire au Centre for
GeoGenetics, Université de Copenhague,
Danemark. Ce laboratoire et LO sont connus pour
avoir effectué la première caractérisation d’ADN
ancien extrait a partir d’archives sédimentaire
(Willerslev et al. 2003), séquence le premier
génôme humain ancien (Rasmussen et al. 2010), le
génome ancien le plus vieux (Orlando et al. 2013)
ainsi que les premiers epigénomes anciens
(Pedersen et al. 2014). LO a publié plus de 130
articles scientifiques, dont une trentaine dans les
journaux Nature et Science. Il est titulaire d’une
bourse ERC Consolidator (#681605) jusqu’en 2021.