Il est aujourd’hui clairement établi que les pressions anthropiques exercées sur les écosystèmes aquatiques en modifient le fonctionnement et impactent la dynamique des micro-organismes qui les composent. Ces écosystèmes deviennent alors des lieux d’évolution rapide des communautés microbiennes pouvant permettre l’émergence et la dissémination de bactéries antibiorésistantes, préoccupation actuelle majeure de santé publique.
Le projet AntibiEaux Montpellier soutenu en 2014 par l’OHM Littoral méditerranéen a permis de suivre l’antibiorésistance de communautés bactériennes dans des cours d’eaux urbains et péri-hospitaliers. Basé sur une approche territoriale du risque infectieux, le projet AntibiEaux2 fait suite à ce premier projet. Il a pour objectif de décrire le gradient des résistances bactériennes dans le continuum aquatique située entre l’aquifère karstique du Lez jusqu’à son embouchure en passant par une zone urbaine incluant un hôpital. Cette étude permet d’aborder la question de la contribution des activités anthropiques à l’émergence et la dissémination de l’antibiorésistance. L’aspect climatique (région soumise à des épisodes cévenols, épisodes climatiques extrêmes) est également considéré lors des échantillonnages, ces variations hydrodynamiques rapides affectant les niches écologiques des micro-organismes.
Des isolats de bactéries résistants à des antibiotiques à large spectre ou multirésistants, dont les bactéries potentiellement pathogènes pour l’homme, seront recherchés et caractérisés afin d’identifier les potentiels réservoirs des gènes de résistance. Le support génétique de la résistance sera également identifié. Les résultats obtenus pourront permettre l’identification de marqueurs d’activité anthropique qui suivent le gradient d’anthropisation de la zone d’observation, ce marqueur pouvant être un gène, une bactérie ou un groupe de bactéries.